高壓滅菌鍋的應用范圍廣泛，在醫療、工廠、化工等單位都需要使用。設備都采用了微電腦智能化全自動控制，控制滅菌壓力以及時間和溫度，還有超溫自動保護裝置、進口斷水檢測裝置、漏電保護裝置、配置電保護裝置等。這些都是現代化高科技的體現，為了廣大消費者的安全使用，自然是要面面俱到。
高壓滅菌鍋使用前的準備應先去檢查電源線和插頭及插座是否安全、狀態是否良好，如不安全應予以更換。其次，還需要使用一小盆盛有適量的冷水將排氣軟管插入到冷去水中。滅菌鍋內加水時應注意水位在擋水板下為宜。使用的水源應該是使用去離子水。
由于高壓滅菌鍋內不僅產生高壓，還會產生高溫水蒸氣，因此為了保障操作人員的安全，防治熱空氣突然噴出，對實驗人員造成傷害，高壓滅菌鍋的開蓋時機選擇非常重要。
在使用時人們普遍存在兩個誤區：
一是認為當高壓滅菌鍋的壓強表數值接近0MPa時就可以打開鍋蓋了，而實際上這個時候鍋內人員有較高的壓強，如果打開鍋蓋，不僅容易對實驗人員造成傷害，而且后如果壓強差值較大，還有可能直接使試管中的的培養基從試管中碰觸，從而造成棉塞被污染，較松的試管塞還可能從試管上脫落。
另一個誤區是認為當壓強指針數值為0時，就可以立即打開鍋蓋取出滅菌物品了，實際上這種想法也是錯誤的，因為雖然表上顯示的壓強值為0，但是此時高溫水蒸氣依然很高，仍然有燙傷的危險，而且如果當時所處的室溫較低的話，比如在冬季，那么在打開鍋蓋之后，冷空氣的突然進入，還有可能造成玻璃器皿炸裂。
因此高壓滅菌鍋正確開蓋實際應該是要確定壓強值為0，并進行稍事降溫之后再開蓋，這樣既不會導致內外壓強差距較大，也不會造成內外溫差較大，此時開蓋，對試驗人員和玻璃器皿的影響最小，也更安全。